Наука Кинезиология берет своё начало с работ самого Аристотеля, который впервые описал действие мышц и осуществил их геометрический анализ.
Буквально с древнегреческого kinesis переводится как движение, logos — знание, наука, то есть дословно Кинезиология — наука, изучающая мышечные движения.
Развитие кинезиологии в современном её понимании началось с 30-40-х гг. XX в., когда физиотерапевты супруги Кендалл разработали систему мышечного тестирования для определения силы мышц в целях проведения неврологической диагностики.
Опираясь на их работы, Джордж Гудхарт (мануальный терапевт и экс-главный врач Олимпийской сборной США) в 60-е гг. XX в. разработал концепцию триединства и назвал её прикладной кинезиологией Applied Kinesiology (т.к. она может использоваться, т.е. прикладываться, при оценки взаимовлияния всех органов и систем).
Позже ученик Гудхарта Джон Даймонд (психиатр, США) занялся исследованием влияния различных эмоциональных состояний на тонус конкретных мышц и активность конкретных меридианов. Он установил влияние позитивных и негативных убеждений, произнесённых пациентом, на функциональное состояние внутренних органов и эндокринной системы. Таким образом родилась поведенческая кинезиология, объединяющая в себе несколько направлений: психиатрию, психосоматику, прикладную кинезиологию, акупунктуру, профилактическую медицину, гуманитарные науки.
В 70-е гг. прошлого века Джон Ти (доктор, США), также ученик Гудхарта, разработал свой подход к балансировке организма через мышечное тестирование: "Целебное прикосновение", где он, опираясь на идеи традиционной китайской медицины, сделал упор на определения гармоничного течения энергии по основным 14 энергетическим меридианам.
На протяжении конца прошлого — начала текущего столетия в мире активно развивались и продолжают развиваться различные направления кинезиологии. Сейчас их насчитывается уже более 100.
В России впервые термин "прикладная кинезиология" стал известен после доклада на конференции по мануальной терапии в мае 1990 г. Президента Европейской коллегии прикладной кинезиологии Джозефа Шейфера и вице-президента Кристофера Смита.
А в 1991 году Кэрол Энн Хонц привезла в Россию курсы "Единого мозга", а позже преподавала всю концепцию "Три в одном". С 1991 по 1997 гг. она регулярно проводила лекции и семинары в Москве и других городах.
Впоследствии в нашей стране в разные годы преподавали такие известные западные кинезиологи как Джон Даймонд, Пол Деннисон, Вейн Топпинг, Франческа Симеон, Хуан Карлос Монте, Мэтью Ти, Марко Радо и др.
Основателем прикладной кинезиологии в России считается профессор, доктор медицинских наук Васильева Людмила Федоровна, Зав. кафедрой мануальной терапии Российского Государственного Медицинского Университета.
В 2000 г. при её содействии зарегистрирована и под её руководством активно действует Межрегиональная ассоциация прикладной кинезиологии (МАПК), объединяющая более 200 врачей разной специальности.
На заре нового тысячелетия в нашей стране благодаря врачу-психотерапевту, к.м.н. Чобану Ирине Константиновне, родилось ещё одно кинезиологическое направление, весьма актуальное в наше эмоционально нестабильное время — психотерапевтическая кинезиология. Это направление призвано помочь человеку справиться с психологическими проблемами, переживаниями, стрессом через телесные техники. Такой подход помогает мягко работать даже с самыми сложными ситуациями, заглянуть самостоятельно в которые человеку зачастую очень трудно, а кинезиологические техники и упражнения, применяемые в ходе сессии, помогают буквально рассеять накопленный стресс и вернуть ощущение внутренней стабильности и эмоциональное равновесие.
В 2006 г. психотерапевтическая кинезиология признана официальным методом психотерапии на заседании комитета по модальностям Профессинальной Психотерапевтической лиги.
А в 2012 г. в России была зарегистрирована Межрегиональная общественная организация по содействию развитию кинезиологии "Ассоциация профессиональных кинезиологов" (МОО АПК).